Jak poprawić poszarpany wykres liniowy w ggplot2?

Czy ich każdy proces poprawy postrzępione linie produkowanych przez geom_line() łączenie wielu punktów do gładkich linii w ggplot2 reprezentacyjnych?Jak poprawić poszarpany wykres liniowy w ggplot2?

 lai.se <- structure(list(DOS = structure(c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 2L, 2L, 
2L, 2L, 2L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L), .Label = c("D1", "D2", "D3"), class = "factor"), 
    DAS = c(31L, 84L, 113L, 132L, 160L, 35L, 82L, 108L, 126L, 
    146L, 37L, 83L, 94L, 113L, 134L), N = c(24L, 24L, 24L, 24L, 
    24L, 24L, 24L, 24L, 24L, 24L, 24L, 24L, 24L, 24L, 24L), LAI = c(1.5879167, 
    4.3241667, 3.70375, 2.9704167, 0.1879167, 1.7679167, 3.7670833, 
    3.4104167, 2.7879167, 0.195, 1.3179167, 3.5233333, 3.1604167, 
    2.45875, 0.2758333), sd = c(0.4276323, 0.32478644, 0.34151596, 
    0.3338638, 0.09868611, 0.18551876, 0.38212767, 0.31431747, 
    0.35024189, 0.08836682, 0.16378616, 0.29256982, 0.28257326, 
    0.44131535, 0.09536733), se = c(0.08729008, 0.06629675, 0.06971165, 
    0.06814966, 0.02014422, 0.03786886, 0.07800148, 0.06415978, 
    0.07149283, 0.0180378, 0.03343271, 0.05972057, 0.05768002, 
    0.09008312, 0.01946677), ci = c(0.18057328, 0.13714529, 0.14420954, 
    0.14097832, 0.04167149, 0.0783377, 0.16135836, 0.13272463, 
    0.14789418, 0.03731404, 0.06916083, 0.1235414, 0.11932022, 
    0.18635113, 0.04027009)), .Names = c("DOS", "DAS", "N", "LAI", 
"sd", "se", "ci"), class = "data.frame", row.names = c(NA, -15L 
)) 
    ggplot(lai.se, aes(x=DAS, y=LAI, colour=DOS)) + 
    geom_errorbar(aes(ymin=LAI-se, ymax=LAI+se), colour ="black", size =.5, width=1, position=position_dodge(.9)) + 
    geom_line() + 
    geom_point()+ theme_bw()

Linie utworzone za pomocą tych kodów były w bardzo dużym stopniu zygzakowate. Czy jest jakikolwiek sposób, aby wydrukować gładsze linie "solid" (nie wyglądające zygzakiem)?

> sessionInfo() 
R version 2.14.2 (2012-02-29) 
Platform: i386-pc-mingw32/i386 (32-bit) 

locale: 
[1] LC_COLLATE=English_India.1252 LC_CTYPE=English_India.1252 LC_MONETARY=English_India.1252 LC_NUMERIC=C     
[5] LC_TIME=English_India.1252  

attached base packages: 
[1] stats  graphics grDevices utils  datasets methods base  

other attached packages: 
[1] ggplot2_0.9.2.1 

loaded via a namespace (and not attached): 
[1] colorspace_1.1-1 dichromat_1.2-4 digest_0.5.2  grid_2.14.2  gtable_0.1.1  labeling_0.1  
[7] MASS_7.3-17  memoise_0.1  munsell_0.4  plyr_1.7.1   proto_0.3-9.2  RColorBrewer_1.0-5 
[13] reshape2_1.2.1  scales_0.2.2  stringr_0.6.1  tools_2.14.2

Źródło

2013-01-14 Barun

masz na myśli antyaliasowanych linie tak ?: https://en.wikipedia.org/wiki/Xiaolin_Wu % 27s_line_algorithm –

zgadzam się z @eznme że jesteś prawdopodobnie odsyłający problemy anty-aliasingu, które są prawdopodobnie związane z urządzeniem drukowanego wykresu aby nie ggplot2 się. Rozwiązanie zależy od konfiguracji platformy i systemu, dlatego poprosiłem o wyjście 'sessionInfo()'. – joran

@joran Dodałem sessionInfo(). proszę pomóż mi. Używam RStudio (0.97.248) – Barun

Zgaduję, że próbujesz wygładzić linię. Czy to jest w parku balowym tego, o co prosisz?

ggplot(lai.se, aes(x=DAS, y=LAI, colour=DOS)) + 
    geom_errorbar(aes(ymin=LAI-se, ymax=LAI+se), colour ="black", size =.5, width=1, position=position_dodge(.9)) + 
    geom_smooth() + 
    geom_point()+ theme_bw()

enter image description here

Źródło

2013-01-14 18:08:28

dzięki za pomoc. ale próbowałem tego. można tu również zauważyć, że utworzone linie są postrzępione. To, czego szukałem, to wysokiej jakości wykresy liniowe, jak te tworzone w MS Excelu (bez pikselizacji). – Barun

Wyjście swój wykres do pliku zapisanego w formacie wektorowym, takich jak PDF lub PostScript, a następnie użyj ImageMagick lub podobny do renderowania ten wektor obrazu do bitmapy (PNG, JPEG, etc .) w wysokiej rozdzielczości (150, 300 lub nawet 600 dpi):

$ convert myGraphAsVector.pdf -density 300 myGraphAs300DpiBitmap.png

rozmiar pliku będzie duża (i uzyskać coraz większy, jak zwiększyć rozdzielczość końcowego produktu), ale jaggedness bitmapy wydaje się oddalać przy wyższym pikselu gęstości.

Źródło

2013-01-14 18:44:12

W swojej odpowiedzi na mój komentarz potwierdzasz, że chcesz anti-alias swoje linie (nie zmienia krzywą swojej działce).

Myślę, że jedynym sposobem, aby to zrobić w R jest wykorzystanie Cairo i tutaj jest tutorial jak to zrobić z kręgów, mam nadzieję, że można dostosować, że aby to zrobić z linii:

http://www.r-bloggers.com/weekend-art-in-r-part-3/

Źródło

2013-01-14 19:17:09

jak wspominają inni, format obrazu wektorowego oparte jak PDF lub SVG może być najlepszym sposobem, aby przejść. Jeśli chcesz korzystać z mapy bitowej, jak PNG, można zwiększyć rozdzielczość obrazu z opcją png()res.

png("myplot.png", width = 1800, height = 1800, res = 600)

to wytworzy 3 cale 3 cale obrazu (wymiary rzeczywistych) przy rozdzielczości 600 dpi. Z mojego doświadczenia wynika, że rozmiar pliku był nadal uzasadniony w przypadku stosunkowo prostych wykresów.

Zobacz ten wpis na blogu po więcej pomysłów, jak poprawić swoje zdjęcia:

http://blog.revolutionanalytics.com/2009/01/10-tips-for-making-your-r-graphics-look-their-best.html

Źródło

2016-02-09 13:04:21 ogdenkev

Jak poprawić poszarpany wykres liniowy w ggplot2?

Odpowiedz

Powiązane problemy