Korzystanie z bibliotek Stanford NLP od wewnątrz R, przy użyciu pakietu rJava

Question

Czy ktoś ma jakieś doświadczenia z użyciem StanfordCoreNLP (http://nlp.stanford.edu/software/corenlp.shtml przez rJava w R? Byłem stara się zmusić go do pracy przez dwa dni teraz, i myślę, że wyczerpałem Google i poprzednie pytania na temat StackOverflow.

Zasadniczo próbuję korzystać z bibliotek StanfordNLP z poziomu R. Mam zerowe doświadczenie z językiem Java, ale doświadczenie z innymi językami, więc rozumiem podstawy dotyczące klas i obiekty itp.

Z tego co widzę plik demo .java że pochodzi z bibliotek wydaje się wskazywać, że aby skorzystać z klas od wewnątrz Java, można importować biblioteki, a następnie utworzyć nowy obiekt, wzdłuż linii:

import java.io.*; 
import java.util.*; 

import edu.stanford.nlp.io.*; 
import edu.stanford.nlp.ling.*; 
import edu.stanford.nlp.pipeline.*; 
import edu.stanford.nlp.trees.*; 
import edu.stanford.nlp.util.*; 

    public class demo { 

     etc. 
     etc. 

     StanfordCoreNLP pipeline = new StanfordCoreNLP(); 

     etc. 

od wewnątrz R, próbowałem wywoływanie niektórych standardowych funkcji java; działa to dobrze, co sprawia, że ​​myślę, że to jest sposób, w jaki próbuję uzyskać dostęp do bibliotek Stanford, które powodują ten problem.

Wyodrębniono plik Stanford ZIP do h: \ stanfordcore, więc pliki .jar znajdują się w katalogu głównym tego katalogu. Jak również różne inne pliki zawarte w zamek błyskawiczny, zawiera główne .jar:

• Joda-time.jar
• Stanford-corenlp-1.3.4.jar
• Stanford-corenlp- 1.3.4-javadoc.jar
• stanford-corenlp-1.3.4-models.jar
• Joda czasie-2,1-sources.jar
• jollyday-0.4.7-sources.jar
• stanford- corenlp-1.3.4-sources.jar
• xom.jar
• jollyday.jar

Gdy próbuję uzyskać dostęp do narzędzi NLP z linii poleceń, to działa dobrze.

Od wewnątrz R, I initalized JVM i ustawić zmienną ścieżce klasy:

.jinit(classpath = " h:/stanfordcore", parameters = getOption("java.parameters"),silent = FALSE, force.init = TRUE) 

Po tym, jeśli mam użyć polecenia

.jclassPath() 

To pokazuje, że katalog zawierający wymaganą .jar pliki zostały dodane i daje to wyjście w R:

[1] "H: \ RProject-2.15.1 \ biblioteka \ rJava \ java" "h: \ stanfordcore"

Jednak gdy próbuję utworzyć nowy obiekt (nie wiem, czy jest to właściwa terminologia Java), pojawia się błąd.

Próbowałem tworzenia obiektu w dziesiątki różnych sposobów (w zasadzie filmowania w ciemności choć), ale najbardziej obiecujące (tylko dlatego, że wydaje się rzeczywiście znaleźć klasę jest):

pipeline <- .jnew(class="edu/stanford/nlp/pipeline/StanfordCoreNLP",check=TRUE,silent=FALSE) 

I Wiem, że to znajduje klasę, ponieważ jeśli zmienię parametr klasy na coś, co nie jest wymienione w interfejsie API, otrzymam komunikat, że nie można znaleźć błędu klasy.

W obecnej jednak, pojawia się błąd:

Błąd w .jnew (class = "edu/Stanford/NLP/rurociąg/StanfordCoreNLP" check = TRUE: java.lang.NoClassDefFoundError : Nie można zainicjować klasy edu.stanford.nlp.pipeline.StanfordCoreNLP

Moje googlowanie wskazuje, że może to mieć związek z brakiem wymaganego pliku .jar, ale całkowicie utknąłem. Czy brakuje mi czegoś oczywistego ?

Jeśli ktoś może wskazać mi choć trochę we właściwym kierunku, byłbym niewiarygodnie wdzięczny.

Z góry dziękuję!

Peter

Answer 1

Twoja ścieżka klasy jest błędna - korzystasz z katalogu, ale masz pliki JAR. Musisz rozpakować wszystkie pliki JAR w określonym katalogu (nietypowym) lub musisz dodać wszystkie pliki JAR do ścieżki klasy (bardziej powszechne). [Oczywiście, będziesz musiał poprawić swoje literówki, ale zakładam, że wynikają one z faktu, że nie używasz kopiowania/wklejania).

PS: użyj listy mailingowej stats-rosuda-devel, jeśli chcesz uzyskać bardziej aktualne odpowiedzi.

Answer 2

Sukces!

Po godzinach majsterkowania udało mi się znaleźć obejście. Jeśli ktoś jest zainteresowany, to właśnie zrobiłem:

• Za pomocą Eclipse, rozpocząłem nowy projekt.

• Następnie utworzyłem katalog o nazwie 'lib' w katalogu głównym projektu i skopiowałem wszystkie pliki .jar ze Stanford do tego katalogu.

• Po tym, edytowałem właściwości projektu w Eclipse, przeszedłem do "Java Build Path", kliknąłem kartę biblioteki.

• Następnie wybieram do importu bibliotek systemu Java.

• Kliknąłem również "Dodaj zewnętrzne słoiki" i wybrałem wszystkie słoiki Stanford z katalogu lib.

• Następnie utworzyłem intentermediary klasy Java, aby wywoływać klasy Stanford (zamiast próbować wywoływać je bezpośrednio z R).

Przykład:

import java.lang.Object; 
import java.util.Properties; 
import java.io.*; 
import java.util.*; 

import edu.stanford.nlp.io.*; 
import edu.stanford.nlp.ling.*; 
import edu.stanford.nlp.pipeline.*; 
import edu.stanford.nlp.trees.*; 
import edu.stanford.nlp.util.*; 


public class NLP { 

    public static void main(String[] args) { 

     Properties props = new Properties(); 
     props.put("annotators", "tokenize"); 
     StanfordCoreNLP coreNLP = new StanfordCoreNLP(props); 
     } 

} 

To nic nie wróci, ale pokazuje, jak obiekt Stanford mogą być tworzone.

• Utwórz projekt za pomocą środowiska Eclipse.

• Z poziomu R, ustaw katalog roboczy na katalog projektu Java/bin (nie jest to bezwzględnie konieczne, ponieważ można zamiast tego dodać katalog ścieżki klasy, ale upraszcza to).

Następnie obiekt może zostać stworzony w R z:

.jinit(classpath = ".") // This initilizes the JVM 
obj = .jnew("NLP") 

Po tym utworzonych w ramach klas Javy pośrednictwa jakichkolwiek metod może być wywołana z:

Name_of_var_to_store_return_value = . jcall(class name, signature type, method, paramters) 

I wciąż nie rozumiem, dlaczego nie mogę nazwać klas Stanford bezpośrednio z R, ale ta metoda działa. Podejrzewam, że @ChristopherManning ma rację i mój problem polega na wywołaniu zewnętrznego słoja z R. Budując go od zera, słoiki Stanford są połączone podczas kompilacji, więc myślę, że to właśnie naprawiło.