marginalna suma w tabelach

Question

Mam ramkę danych z wieloma infekcjami zidentyfikowanymi z izolatów klinicznych w różnych terminach.

Do tej pory uporządkowałem dane do kształtu, z którym chcę rozpocząć pracę. Próbuję przygotować serię tabel tabel dla statystyki opisowej raportu.

Używam ftable i uzyskać następujące:

onset.types <- ftable(SAB$Onset,SAB$MRSA.Type,year(SAB$Collection.Date)) 
          2005 2006 2007 2008 2009 2010 

Community      454 472 512 499 525 512 
      AUS-2/3-like   28 23 27 29 32 38 
      EMRSA-15-like   9 4 4 9 8 8 
      nmMRSA    40 47 53 39 64 60 
      Other mMRSA   1 3 3 11 5 9 
      unclassified MRSA  0 2 0 0 1 1 
Hospital      163 163 156 164 149 165 
      AUS-2/3-like   31 33 27 31 29 28 
      EMRSA-15-like   3 8 5 9 4 3 
      nmMRSA    10 9 13 17 13 12 
      Other mMRSA   5 1 6 2 3 10 
      unclassified MRSA  2 0 1 0 0 0 

dwa pytania:

1: Jak obliczyć marginalne sumy

2: Czy istnieje prosty sposób obliczyć procenty a także ponownie się liczy z marginalnymi sumami

Próbowałem epitoolów i nie uznałem tego za tak użyteczny, jak bym chciał.

Wielkie dzięki.

Answer 1

Aby dodać marginesy, użyj addmargins()

addmargins(table(state.division, state.region)) 
        state.region 
state.division  Northeast South North Central West Sum 
    New England    6  0    0 0 6 
    Middle Atlantic   3  0    0 0 3 
    South Atlantic    0  8    0 0 8 
    East South Central   0  4    0 0 4 
    West South Central   0  4    0 0 4 
    East North Central   0  0    5 0 5 
    West North Central   0  0    7 0 7 
    Mountain     0  0    0 8 8 
    Pacific     0  0    0 5 5 
    Sum      9 16   12 13 50 

Do obliczenia procentowe, użyj prop.table()

prop.table(table(state.division, state.region)) 
        state.region 
state.division  Northeast South North Central West 
    New England    0.12 0.00   0.00 0.00 
    Middle Atlantic   0.06 0.00   0.00 0.00 
    South Atlantic   0.00 0.16   0.00 0.00 
    East South Central  0.00 0.08   0.00 0.00 
    West South Central  0.00 0.08   0.00 0.00 
    East North Central  0.00 0.00   0.10 0.00 
    West North Central  0.00 0.00   0.14 0.00 
    Mountain    0.00 0.00   0.00 0.16 
    Pacific     0.00 0.00   0.00 0.10