Jak zastąpić limit pamięci 2 GB, gdy R uruchamia się

Question

Gdy R jest uruchamiane, limit pamięci (zwrócony przez memory.limit) jest ustawiony na 2 GB, niezależnie od dostępnej pamięci w komputerze. (I found that out recently). Wyobrażam sobie, że w pewnym momencie procesu uruchamiania ten limit jest ustawiony na faktycznie dostępną pamięć.

Można to zobaczyć, drukując memory.limit() w pliku .Rprofile, który jest pobierany podczas uruchamiania. Wyświetla "2047". Z drugiej strony, gdy R uruchomi się, a ja wpisuję w konsoli memory.limit(), otrzymuję "16289".

Używam niestandardowego pliku .Rprofile i podczas uruchamiania muszę mieć dostęp do ponad 2 GB.

W jaki sposób można zmienić ten limit?

Moje bieżące obejście polega na ustaleniu limitu w profilu .Rp przy użyciu memory.limit(size=16289), ale będę musiał edytować to za każdym razem, gdy pracuję na komputerze z inną ilością pamięci RAM, co zdarza się dość często.

Czy istnieje opcja, którą mogę zmienić, plik .ini, który mogę edytować, czy cokolwiek co mogę z tym zrobić?

OS i R wersja:

> sessionInfo() 
R version 3.2.2 (2015-08-14) 
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit) 
Running under: Windows 7 x64 (build 7601) Service Pack 1 

Edit: to nie duplikat, przynajmniej nie duplikat proponowanego pytanie. Nie chodzi o zarządzanie dostępną pamięcią! Mam 16 GB pamięci, a memory.limit() pokazuje, że mój limit to 16 GB.

Wszystko zaczęło się, gdy otrzymałem ostrzeżenie, że "osiągnąłem 2 GB alokacji pamięci" (co sugeruje, że mam limit 2GB pamięci). Po przeprowadzeniu dochodzenia okazuje się, że indeed R limits the memory at 2GB during the startup process.

Chcę załadować moje dane automatycznie po uruchomieniu R, do tego mam mały skrypt ładujący w .Rprofile. Ładuję więcej niż 2 GB danych, dlatego muszę mieć dostęp do mojego 16 GB. Moje pytanie dotyczy tego. Ma to w ogóle nic w wspólnego z proponowanym dwóch egzemplarzach, z wyjątkiem słów kluczowych ...

Answer 1

mam interpretowania tego, jak chce memory.limit(size=16289) w pliku .RProfile, ale nie chcesz, aby ustawić określoną liczbę każdego czas zmienić komputery z inną pamięcią. Dlaczego po prostu dynamicznie przyciągać pamięć, której potrzebujesz? W oknach:

TOT_MEM <- as.numeric(gsub("\r","",gsub("TotalVisibleMemorySize=","",system('wmic OS get TotalVisibleMemorySize /Value',intern=TRUE)[3])))/1024 
memory.limit(size=TOT_MEM) 

które ustawić ilość dostępnej pamięci do całkowitej pamięci systemu lub

FREE_MEM <- as.numeric(gsub("\r","",gsub("FreePhysicalMemory=","",system('wmic OS get FreePhysicalMemory /Value',intern=TRUE)[3])))/1024 
memory.limit(size=FREE_MEM) 

które ustawione memory.limit do całkowitej dostępnej pamięci na bagażniku.

Umieść to w RProfile, powyżej miejsca wczytywania danych.