Zbudowałem i uruchomiłem model regresji logistycznej efektów mieszanych w pakiecie lme4 dla r, aby oszacować prawdopodobieństwo obłożenia ryb w różnych lokalizacjach (komórki/siedliska). Ramka danych składa się z 1 207 140 obserwacji 68 pojedynczych ryb. Dla każdej osoby (dziennie przez ~ 1 rok) opisuje ona liczbę zdarzeń w każdej unikalnej lokalizacji w stosunku do całkowitej liczby zdarzeń we wszystkich lokalizacjach.Zrozumieć komunikaty ostrzegawcze dla modelu mieszanego w r lme4
Oto model podstawowy:
m.base = glmer(cbind(N,t.move-N) ~ jdate + snSurface.Area + Restoration..P.A. +
Release.Location+ Sex + (1|Station) + (0 + jdate|ID), data=allfishdat, family=binomial)
where N=# unique positions, t.move=total positions, jdate=julian date, Station=locations, ID=fish ID
pojawia się następujący komunikat ostrzegawczy:
Warning messages:
1: In checkConv(attr(opt, "derivs"), opt$par, ctrl = control$checkConv, :
Model failed to converge with max|grad| = 3349.26 (tol = 0.001)
2: In if (resHess$code != 0) { :
the condition has length > 1 and only the first element will be used
3: In checkConv(attr(opt, "derivs"), opt$par, ctrl = control$checkConv, :
Model is nearly unidentifiable: very large eigenvalue
- Rescale variables?;Model is nearly unidentifiable: large eigenvalue ratio
- Rescale variables?
zrobiłem kilka wyszukiwania, aby spróbować zrozumieć, co te komunikaty oznaczają i ich konsekwencje na modelu, ale jeszcze nie zrozumieli ostrzeżenia.
Czy możesz powiedzieć, co pan spojrzał na już, a to, co robisz i nie rozumieją? Czytałeś https://github.com/lme4/lme4/blob/master/README.md? http://stackoverflow.com/questions/23814130/glmer-model-from-early-2013-warning-message-about-convergence-when-re-running-i/23839952#23839952? http://stackoverflow.com/questions/21344555/convergence-error-for-development-version-of-lme4? –
Bump. Pomogłoby Ci to, gdybyś mógł powiedzieć, co masz i czego nie zrozumiałeś - cieszę się, że mogę Ci pomóc, ale nie mam ochoty powtarzać informacji, które już tam są ... –
Guz wypukłości ..... –