"NAs wprowadzone przez przymus" podczas analizy klastra w R

Question

Guys Jestem nowy w tym języku, używam analizy skupień w ramce danych, ale kiedy obliczam odległość, otrzymuję to ostrzeżenie "NAs wprowadzone przez przymus". Co to znaczy?

d <- dist(as.matrix(mydata1)) 

    Warning message: 
In dist(as.matrix(mydata1)) : NAs introduced by coercion 

Moja próbka danych jest

Metafamily  Total   July cpc  July cse_pla July offline July organic 
xerox 8560  275.829417 0.20943223 0.032628862  0.169210813 0.1130048 
office-supplie 246.9125664 0.057833047 0.020209909  0.535358617 0.136165617 

W ten oprócz kolumny Metafamily wszystkie kolumny są numeryczne w klasie.

Chłopaki, proszę, pomóżcie mi rozwiązać ten problem.

Answer 1

Jest to pierwsza kolumna, która stwarza problem:

> a <- c("1", "2",letters[1:5], "3") 
> as.numeric(a) 
[1] 1 2 NA NA NA NA NA 3 
Warning message: 
NAs introduced by coercion 

Wewnątrz dist musi istnieć przymus na numeryczny, który generuje NA jak wyżej.

ja bym sugestię zastosowania dist bez pierwszej kolumnie lub lepszy ruch, który do rownames jeśli to możliwe, ponieważ wynik będzie inny:

> dist(df) 
      1   2   3   4 
2 1.8842186        
3 1.9262360 1.2856110      
4 3.2137871 1.7322788 2.9838920   
5 1.3299455 0.9872963 1.9158079 1.8889050 
Warning message: 
In dist(df) : NAs introduced by coercion 
> dist(df[-1]) 
     1  2  3  4 
2 1.538458       
3 1.572765 1.049697     
4 2.624046 1.414400 2.436338   
5 1.085896 0.806124 1.564251 1.542284 

btw: nie trzeba as.matrix Dzwoniąc dist. W każdym razie to zrobi wewnętrznie.

EDIT: przy użyciu rownames

rownames(df) <- df$id 

> df 
    id  var1  var2 
A A -0.6264538 -0.8204684 
B B 0.1836433 0.4874291 
C C -0.8356286 0.7383247 
D D 1.5952808 0.5757814 
E E 0.3295078 -0.3053884 

> dist(df[-1]) # you colud also remove the 1st col at all, using df$id <- NULL. 
     A  B  C  D 
B 1.538458       
C 1.572765 1.049697     
D 2.624046 1.414400 2.436338   
E 1.085896 0.806124 1.564251 1.542284