igraph

6Ciepło

1Odpowiedz

Jak mogę kolorować węzły i krawędzie z macierzy sąsiedztwa w r?

Mam dwie macierze sąsiadujące dynamicznej sieci w plikach tekstowych, okres 1 i 2 w R (igraph). Chciałbym pokolorować wierzchołki i krawędzie, które są nowe w drugiej sieci na zielono. Na przykład pie

8Ciepło

1Odpowiedz

generowanie wykresu społeczności w igraph

Szukałem odpowiedzi na to pytanie, ale nie mogłem znaleźć żadnej wzmianki, więc zdecydowałem się opublikować tutaj. Próbuję sprawdzić, czy igraph lub jakiekolwiek pakiety zapewniają prosty sposób twor

7Ciepło

2Odpowiedz

pomocą graph.adjacency (R) w

Mam kod próbki na badania w następujący sposób: library(igraph) rm(list=ls()) dat=read.csv(file.choose(),header=TRUE,row.names=1,check.names=T) # read .csv file m=as.matrix(dat) net=graph.adjacenc

5Ciepło

2Odpowiedz

Jak uzyskać wierzchołki na najkrótszej ścieżce za pomocą funkcji igraph?

Używam igraph do generowania macierzy o najkrótszych odległościach między parami wierzchołków, ale nie mogę wymyślić, jak zwrócić wierzchołki. Do tej pory mam: path_length_matrix = ig_graph.shortest_p

14Ciepło

2Odpowiedz

python + igraph "plotowanie niedostępne"

Zainstalowałem python-igraph 0.5.4 i igraph 0.5.4 (również testowany 0.6) ze źródła na maszynie RHEL. Wszystko jest w porządku, z wyjątkiem sytuacji, gdy próbuję knuć, co dostaję. „TypeError: kreśleni

5Ciepło

1Odpowiedz

kontrolujący krawędzie widoczne na wykresie sieci w igraph w R

że ma następujący schemat utworzony w igraph set.seed(1410) df<-data.frame( "site.x"=c(rep("a",4),rep("b",4),rep("c",4),rep("d",4)), "site.y"=c(rep(c("e","f","g","h"),4)), "bond.strength"=sample(1:

9Ciepło

2Odpowiedz

Importuj ważony edgelist za pomocą igraph

Mam następujący plik txt reprezentujący sieć w formacie edgelist. Pierwsze dwie kolumny reprezentują zwykle: który węzeł jest połączony z których inne węzły trzecia kolumna wagi, co oznacza, ile razy

12Ciepło

3Odpowiedz

R igraph przekonwertować równoległe krawędzie do atrybutu wagi

Pracuję z igraph dla R. Mój wykres jest oparty na edgelist, który zawiera równoległe krawędzie (więcej niż jeden brzeg z tego samego źródła i celu). Chciałbym przekonwertować te równoległe krawędzie d

25Ciepło

3Odpowiedz

Który układ powinienem użyć, aby uzyskać niepokrywające się krawędzie w igraph?

Próbuję tworzyć wykresy przy użyciu danych drzewiastych, w których węzły zazwyczaj dzielą się na> 2 krawędzie. Próbowałem różnych układów i widzę, że parametr layout.reingold.tilford wygeneruje wykres

7Ciepło

2Odpowiedz

Jak kopać dla motywów w R z iGraph

Próbuję kopalni dla 3-węzłowych motywów w R za pomocą pakietu igraph. Chciałbym pobrać liczbę motywów dla każdego pojedynczego wierzchołka na wykresie, co nie jest możliwe z funkcji graph.motifs(). Ta