Czy istnieje trwałe miejsce, które jest zawsze zapisywalne, które może być używane jako pamięć podręczna danych przez pakiet?

Question

Czy istnieje predefiniowana lokalizacja, w której pakiet R może przechowywać dane z pamięci podręcznej? Dane powinny być przechowywane w różnych sesjach. Myślałem o stworzeniu podkatalogu ${R_LIBS_USER}/package_name, ale nie jestem pewien, czy jest to przenośne i czy jest to "dozwolone", jeśli mój pakiet jest zainstalowany na cały system.

Idea jest następująca: Utwórz skrypt R mydata.R w podkatalogu data pakietu, który będzie wykonywany przez wywołanie data(mydata) (zgodnie z dokumentacją data()). Ten skrypt ładowałby dane z Internetu i zapisywał je w pamięci podręcznej, jeśli nie był wcześniej buforowany. (Jeśli dane zostały już zapisane w pamięci podręcznej, pamięć podręczna zostanie wykorzystana.) Dodatkowo zostanie udostępniona funkcja umożliwiająca unieważnienie pamięci podręcznej i/lub sprawdzenie, czy nowsza wersja danych jest dostępna online.

to z dokumentacji data():

Obecnie cztery formaty plików danych są obsługiwane:

1. pliki kończący '.R' lub '.r' są źródłem() dw, z katalogiem roboczym R tymczasowo zmienionym na katalog zawierający odpowiedni plik. (Dane gwarantuje, że pakiet utils jest dołączony, w przypadku, gdy zostały uruchomić poprzez dane Utils ::.)

2. ...

Rzeczywiście, tworząc plik fortytwo.R w podkatalogu data opakowania z następujących zawartości:

fortytwo = data.frame(answer=42) 

i wykonującego data(fortytwo) tworzy zmienną ramki danych fortytwo. Teraz pytanie brzmi: Gdzie byłoby fortytwo.R buforować dane, gdyby było to trudne do obliczenia?

EDIT: myślę o tworzeniu dwóch pakietów: Pakiet „dane”, które dostarcza danych oraz pakiet „kod”, który działa na nim. Pytanie dotyczy pakietu "data": Gdzie można przechowywać pliki w pamięci masowej dla poszczególnych użytkowników, aby było trwałe w sesjach R i było dostępne z różnych projektów R?

Powiązane: Package that downloads data from the internet during installation.

Answer 1

Czy przeglądałeś bazy danych w pamięci? H2 & Redis ma powiązania w R za pośrednictwem RH2 & rredis - oba pozwalają na udostępnianie danych w trakcie r sesji - do momentu, gdy sesja tworzenia będzie żyła. w celu utrzymania go w sesjach bezkonkurencyjnych, musisz zapisać swoje dane na dysku (zakładając, że nie możesz odtworzyć go w locie - który mógłby pokonać cel tego pytania) i uważam, że dane pakiet byłby dobrym rozwiązaniem. W ten sposób możesz dodać funkcję aktualizacji, która inicjuje za każdym razem, gdy ładujesz pakiet (tj. Jeśli pakiet kodu ma właściwe zależności).

Przykładem są pakiety RWeka & RWekaJars. Sprawdź je w CRAN i zrozumienie ich działania powinno być dość łatwe.

Answer 2

Nie ma absolutnie zdefiniowanej lokalizacji dla trwałego buforowania specyficznego dla pakietu w R.Jednak R.cache package zapewnia interfejs do tworzenia i zarządzania buforowanymi danymi. Wygląda na to, że może się przydać w twoim scenariuszu.

Gdy użytkownicy załadować R.cache (library(R.cache)), ale pojawia się następujący komunikat:

The R.cache package needs to create a directory that will hold cache files. 
It is convenient to use one in the user's home directory, because it remains 
also after restarting R. Do you wish to create the '~/.Rcache/' directory? If 
not, a temporary directory (/tmp/RtmpqdUcbP/.Rcache) that is specific to this 
R session will be used. [Y/n]: 

Mogą wybrać, aby utworzyć katalog cache w swoim katalogu domowym, który jest przypuszczalnie trwałe, lub utworzyć katalog specyficzny dla sesji. Jeśli sprawisz, że twój pakiet danych będzie zależał od R.cache, możesz sprawdzić istnienie obiektu (obiektów) buforowanych w jego funkcji przechwytywania .onLoad() i pobrać dane, jeśli ich tam nie ma. Alternatywnie możesz zrobić to w sposób sugerowany w twoim własnym pytaniu.