Saving numpy tablicy do csv produkuje TypeError Niezgodność

Question

mam numpy tablicę z danych liczbowych w postaci:

example = numpy.array([[[i for i in range(0, 5)],[0 for j in range(0, 5)]] for k in range(0, 10)]) 

więc jest to tablica 10 grupach, gdzie każda grupa składa się z 2 list o równej długości i zawiera tylko liczby. uruchamiając następujące Zapisz kod daje mi błąd poniżej:

numpy.savetxt('exampleData.csv', test, delimiter=',') 
TypeError: Mismatch between array dtype ('int32') and format specifier ('%.18e %.18e') 

Zgaduję, to może być ustalona z czymś w FMT = „xyz” argumentu, ale dokumentacja nie jest szczególnie wyraźny. Każda pomoc będzie doceniona.

(Z moich danych rzeczywistych, I i J listy są listami długich pływaków, eg'0.0047322940571' etc.)

Answer 1

swojej example jest 3D array

In [82]: example=np.array([[[i for i in range(0, 5)],[0 for j in range(0, 5)]] for k in range(0, 3)]) # chg 10 to 3 for display 

In [83]: example.shape 
Out[83]: (3L, 2L, 5L) 

In [84]: example 
Out[84]: 
array([[[0, 1, 2, 3, 4], 
     [0, 0, 0, 0, 0]], 

     [[0, 1, 2, 3, 4], 
     [0, 0, 0, 0, 0]], 

     [[0, 1, 2, 3, 4], 
     [0, 0, 0, 0, 0]]]) 

próbuje zapisz całość powoduje błąd (inna wiadomość ze względu na inną wersję):

In [87]: np.savetxt('test.csv',example, delimiter=',') 
.... 
TypeError: float argument required, not numpy.ndarray 

ale sav ing jeden wiersz „” jest ok

In [88]: np.savetxt('test.csv',example[1,...], delimiter=',') 

Zapisz w formacie liczby całkowitej sprawia ładniejsza wyjście

In [94]: np.savetxt('test.csv',example[1,...], delimiter=',',fmt='%d') 

In [95]: with open('test.csv') as f:print f.read() 
0,1,2,3,4 
0,0,0,0,0 

Więc jak chcesz 3d tablica być zbawiony? Pamiętaj, że będziesz go używać/czytać. Wiele plików? Wiele bloków w jednym pliku?

https://stackoverflow.com/a/3685339/901925 to 6-letnia odpowiedź na pytanie, jak zapisać tablicę 3d. Prostą odpowiedzią jest otworzenie pliku i wykonanie wielu wycinków z tablicy . To zapisuje dane w blokach. Ale ładowanie tych bloków to kolejne pytanie SO (które pojawiło się wcześniej).

In [100]: with open('test.csv','w') as f: 
    ...:  for row in example: 
    ...:   np.savetxt(f,row,delimiter=',',fmt='%d',footer='====') 
    ...:   

In [101]: with open('test.csv') as f:print f.read() 
0,1,2,3,4 
0,0,0,0,0 
# ==== 
0,1,2,3,4 
0,0,0,0,0 
# ==== 
0,1,2,3,4 
0,0,0,0,0 
# ==== 

W odpowiedzi na Twój komentarz, to działa

example=np.ones((4,2,100)) 
np.savetxt('test.csv',example[1,...], delimiter=',',fmt='%.18e') 

Innym sposobem na zaoszczędzenie 3d tablica jest do przekształcenia go do 2d. Ci przekształcić go z powrotem do 3d po załadunku, ewentualnie za pomocą informacji, które przechowywane w wierszu komentarza

np.savetxt('test.csv',example.reshape(-1,example.shape[-1]), delimiter=',',fmt='%.18e') 

Answer 2

import numpy 

example = numpy.array([[[i for i in range(0, 5)],[0 for j in range(0, 5)]] for k in range(0, 10)]) 
f = open('exampleData.csv', 'ab') 
for i in example: 
    numpy.savetxt(f, i, fmt='%i')