R - scalić listę ramek danych w jednej ramce danych z brakujących wartości przez rząd

Question

Mam wariacja na jakże powszechny problem, w jaki sposób połączyć wszystko razem w R.

Mam zestaw .txt pliki w danym folderze, a ja napisałem funkcję:

• tworzy listę plików, które chcę, a następnie dla każdego pliku
• odczytuje plik
• podzbiory danych (do wyodrębnij tylko interesujące wiersze i kolumny)
• wykonuje niektóre obliczenia na danych
• dodaje te nowe wartości do listy.

Co ja skończyć z jest lista o następującej strukturze:

>str(DataList) 
List of 16 
$ :'data.frame': 14 obs. of 2 variables: 
    ..$ Sample: Factor w/ 14 levels "Sample_1A","Sample_1B",..: 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ... 
    ..$ Var1 : num [1:14] 27.9 33.8 29.9 29.4 28.8 ... 
$ :'data.frame': 14 obs. of 2 variables: 
    ..$ Sample: Factor w/ 14 levels "Sample_1A","Sample_1B",..: 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ... 
    ..$ Var2 : num [1:14] 24.6 27 26.8 26.7 27.2 ... 
$ :'data.frame': 12 obs. of 2 variables: 
    ..$ Sample: Factor w/ 14 levels "Sample_1A","Sample_1B",..: 1 2 3 4 5 6 7 9 11 12 ... 
    ..$ Var3 : num [1:12] 31.4 35.6 34 35.7 32.5 ... 

Dla każdej zmiennej (Var1, Var2, Var3, ...) Mam kolumny Sample i kolumny wartości liczbowych.

Sample jest zawsze czynnikiem o 14 poziomach; te poziomy są takie same dla każdej zmiennej.

Problem polega na tym, że niektóre zmienne (np. Var3 powyżej) nie mają obserwacji dla każdego poziomu Sample.

Co chcę zakończyć, to ramka danych z 14 rzędami (po jednym dla każdego poziomu Sample). Pierwsza kolumna powinna być Sample; Następnie dla każdej zmiennej, nie powinno być kolumną zawierającą odpowiednie wartości liczbowe, tak jak poniżej:

Sample  Var1 Var2 Var3 
Sample_1A 27.9 24.6 31.4 
Sample_1B 33.8 27  35.6 
... 
Sample_3B 26.8 29.7 NA 

Próbowałem to zrobić z do.call, ale nie wiem jak przekazać argumenty za by; cbind zostaje niezadowolony z powodu brakujących wartości. Wszelkie przemyślenia, jak to zrobić?

Dzięki!

EDIT: Jak na zamówienie Jøran za:

>dput(DataList[1:3]) 
list(structure(list(Sample = structure(1:14, .Label = c("Sample_1B", "Sample_1C", "Sample_1D", "Sample_2C", "Sample_2A", "Sample_2D", "Sample_3B", "Sample_3C", "Sample_3A", "Sample_3D", "Sample_4B", "Sample_4C", "Sample_4A", "Sample_4D"), class = "factor"), Var1 = c(26.9333333333333, 29.17, 28.9366666666667, 28.9233333333333, 28.61, 28.63, 26.7933333333333, 34.6633333333333, 30.4966666666667, 28.4433333333333, 27.4533333333333, 28.3, 27.9633333333333, 27.2366666666667)), .Names = c("Sample", "Var1"), row.names = c(NA, -14L), class = "data.frame"), structure(list(Sample = structure(1:14, .Label = c("Sample_1B", "Sample_1C", "Sample_1D", "Sample_2C", "Sample_2A", "Sample_2D", "Sample_3B", "Sample_3C", "Sample_3A", "Sample_3D", "Sample_4B", "Sample_4C", "Sample_4A", "Sample_4D"), class = "factor"),          Var2 = c(24.19, 26.6033333333333, 26.0366666666667, 27.6766666666667, 27.61, 27.5633333333333, 25.1566666666667, 33.7266666666667, 27.7, 26.1466666666667, 25.65, 26.3633333333333, 25.5333333333333, 26.1733333333333)), .Names = c("Sample", "Var2"), row.names = c(NA, -14L), class = "data.frame"), structure(list(Sample = structure(c(1L, 2L, 3L, 4L, 5L, 6L, 7L, 9L, 11L, 12L, 13L, 14L), .Label = c("Sample_1B", "Sample_1C", "Sample_1D", "Sample_2C", "Sample_2A", "Sample_2D", "Sample_3B", "Sample_3C", "Sample_3A", "Sample_3D", "Sample_4B", "Sample_4C", "Sample_4A", "Sample_4D"), class = "factor"), Var3 = c(31.4133333333333, 35.56, 33.9666666666667, 35.66, 32.4633333333333, 31.99, 31.3133333333333, 36.34, 34.9433333333333, 34.5433333333333, 34.3766666666667, 33.28)), .Names = c("Sample", "Var3"), row.names = c(NA, -12L), class = "data.frame")) 

Answer 1

Wygląda przypadku użycia podręcznik dla Reduce.

merge.all <- function(x, y) { 
    merge(x, y, all=TRUE, by="Sample") 
} 

output <- Reduce(merge.all, DataList)