rcpp

    5Ciepło

    1Odpowiedz

    Jaki jest najlepszy sposób przekazania wektora R booleansa do wektora C++ dynamic_bitset? Czy istnieje sposób użycia wskaźnika i długości wektora do skonstruowania obiektu dynamic_bitset, jaki byłby m

    9Ciepło

    3Odpowiedz

    pracuję moja droga przez Rcpp tutorialu Dirk Eddelbuettel tu: http://www.rinfinance.com/agenda/ nauczyłem się jak zapisać C++ plik w katalogu i nazywają go i uruchomić go z w ciągu R. C++ pliku używam

    9Ciepło

    1Odpowiedz

    Używam R 2.15.3 na Ubuntu 12.04 (precyzyjne) 64-bit. Jeśli biegnę R w valgrind: R -d "valgrind" --vanilla I wtedy wyjść z programu za pomocą q() i pojawia się następujący raport: ==7167== HEAP SUMMARY

    9Ciepło

    1Odpowiedz

    Jestem zaintrygowany. Poniższy skompilować i działa prawidłowo: #include <Rcpp.h> using namespace Rcpp; // [[Rcpp::export]] List test(){ List l; IntegerVector v(5, NA_INTEGER); l.pus

    5Ciepło

    2Odpowiedz

    Jak przekazać mapę/słownik/listę z R jako parametr do funkcji C++? Na przykład, chcę zrobić coś jak następuje: #include <Rcpp.h> using namespace Rcpp; // [[Rcpp::export]] int test(List map) {

    5Ciepło

    1Odpowiedz

    I tej linii kodu r: croppedDNA <- completeDNA[,apply(completeDNA,2,function(x) any(c(FALSE,x[-length(x)]!=x[-1])))] co robi to identyfikacji miejsc (cols) w matrycy z sekwencjami DNA (1 wiersz = z S

    5Ciepło

    1Odpowiedz

    Próbowałem zainstalować RcppEigen na Amazon EC2 (na t1.micro do upewnij się, że działa) & ubuntu 13.04. Próbowałem z obu wersji R był 2.15.2 i 3.0, 32bit ubuntu i 64bit unbuntu. Za każdym razem otrzym

    5Ciepło

    1Odpowiedz

    używam następujące kroki, aby osiągnąć mój własny pakiet: 1) Staram się pisać bardzo prostą funkcję w następujący sposób: #include <Rcpp.h> using namespace Rcpp; // [[Rcpp::export]] int foo() { r

    11Ciepło

    1Odpowiedz

    Chciałem wiedzieć, czy istnieje ograniczenie liczby wierszy, które można odczytać za pomocą funkcji data.table fread. Pracuję z tabelą z 4 miliardami wierszy, 4 kolumnami, około 40 GB. Wygląda na to,

    5Ciepło

    2Odpowiedz

    Muszę obliczyć miarę podobieństwa, wywołując współczynnik Dice na dużych macierzach (600 000 x 500) wektorów binarnych w R. Dla prędkości używam C/Rcpp. Ta funkcja działa świetnie, ale ponieważ nie je