2017-07-26 23 views
8

Próbuję zainstalować pakiet igraph w R.But uzyskiwanie błędu w obcej-graphml.c poniżej:Uzyskiwanie błąd „funkcja«igraph_write_graph_graphml»:” podczas instalacji pakietu w igraph R

foreign-graphml.c: In function ‘igraph_write_graph_graphml’: 
foreign-graphml.c:1408:46: error: expected ‘)’ before ‘GRAPHML_NAMESPACE_URI’ 
    ret=fprintf(outstream, "<graphml xmlns=\"" GRAPHML_NAMESPACE_URI "\"\n"); 
              ^
foreign-graphml.c:1412:59: error: expected ‘)’ before ‘GRAPHML_NAMESPACE_URI’ 
    ret=fprintf(outstream, "   xsi:schemaLocation=\"" GRAPHML_NAMESPACE_URI 
                 ^
foreign-graphml.c:1414:38: error: expected ‘)’ before ‘GRAPHML_NAMESPACE_URI’ 
    ret=fprintf(outstream, "   " GRAPHML_NAMESPACE_URI "/1.0/graphml.xsd\"> 
            ^
/usr/lib/R/etc/Makeconf:134: recipe for target 'foreign-graphml.o' failed 
make: *** [foreign-graphml.o] Error 1 
ERROR: compilation failed for package ‘igraph’ 
* removing ‘/home/evangeline/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/igraph’ 

The downloaded source packages are in 
    ‘/tmp/Rtmp9eBTml/downloaded_packages’ 
Warning message: 
In install.packages("igraph") : 
    installation of package ‘igraph’ had non-zero exit status 

życzliwej pomocy odpadam.

Proszę znaleźć sessionInfo: sessionInfo:

R version 3.2.3 (2015-12-10) 
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit) 
Running under: Ubuntu 16.04.2 LTS 

locale: 
[1] LC_CTYPE=en_IN  LC_NUMERIC=C   LC_TIME=en_IN  
[4] LC_COLLATE=en_IN  LC_MONETARY=en_IN LC_MESSAGES=en_IN 
[7] LC_PAPER=en_IN  LC_NAME=C   LC_ADDRESS=C   
[10] LC_TELEPHONE=C  LC_MEASUREMENT=en_IN LC_IDENTIFICATION=C 

attached base packages: 
[1] stats  graphics grDevices utils  datasets methods base 
+0

Należy wyjaśnić swoje pytanie nieco więcej. – Difster

+0

Nie mogę zainstalować igraph w systemie Unix, kompilacja nie powiodła się błąd – Evangeline

Odpowiedz

16

miałem ten sam problem. Podobnie jak poprzedni plakat (zwartemond), jest to błąd w igraph. Właściciel repozytorium github naprawił błąd, ale aktualizacja pakietu na CRAN zajmie trochę czasu, będziesz musiał poczekać jakiś czas (około 2 tygodni?).

Aby zainstalować pakiet igraph bezpośrednio z użytkowania DevTools źródło:

install.packages("devtools") 
library(devtools) 
install_github("igraph/rigraph") 

Ten pracował dla mnie.

+1

To działało dla mnie po zainstalowaniu libcurl-devel przez dnf w Fedorze 25. – Jefferson

+1

To działało dla mnie (używając RStudio 1.01, R 3.4.1) – EA304GT

+0

O ubuntu I zainstalowałem libcurl4-openssl-dev przed wykonaniem powyższych kroków. – Jefferson

13

miałem problem saime i rozwiązać go, wpisując w terminalu

sudo apt-get install libssl-dev 
sudo apt-get install libcurl4-openssl-dev 
sudo apt-get install libxml2-dev 
+2

Ta odpowiedź powinna zostać przyjęta! – Belter

+1

'sudo apt-get install libcurl4-openssl-dev libssl-dev libxml2-dev' działa również jako jedna linia – dsliberty

+0

Dla CentOS lub RHEL można to zrobić za pomocą' sudo yum install libxml2-devel libcurl-devel openssl-devel' – rodrigobb