bioinformatics

14Ciepło

8Odpowiedz

Znajdowanie pasujących kluczy w dwóch dużych słownikach i robienie tego szybko

Próbuję znaleźć odpowiednie klucze w dwóch różnych słownikach. Każdy ma około 600 000 wpisów. Powiedz na przykład: myRDP = { 'Actinobacter': 'GATCGA...TCA', 'subtilus sp.': 'ATCGATT...ACT' } myNa

python bioinformatics 2009-08-23

---

5Ciepło

6Odpowiedz

Jak mogę rozmawiać z UniProt przez HTTP w Pythonie?

Próbuję uzyskać wyniki z UniProt, która jest bazą danych białek (szczegóły nie są ważne). Próbuję użyć skryptu, który przekłada się z jednego rodzaju identyfikatora na inny. Mogłem to zrobić ręcznie w

python http user-agent bioinformatics 2009-04-03

---

6Ciepło

4Odpowiedz

sprawdzania rekordów DNS usługi, aby znaleźć nazwę hosta i TCP/IP

w artykule o Life Science Identyfikatory (patrz LSID Tester, a tool for testing Life Science Identifier resolution services), dr Roderic DM Page napisał: Biorąc pod urnę LSID: lsid **: ubio.org **: na

java dns host bioinformatics 2009-04-10

---

6Ciepło

5Odpowiedz

Generowanie sekwencji DNA syntetyczny z Subtitution Rate

Biorąc pod uwagę te wejść: my $init_seq = "AAAAAAAAAA" #length 10 bp my $sub_rate = 0.003; my $nof_tags = 1000; my @dna = qw(A C G T); Chcę, aby wygenerować: tysiąc długości 10 Tagi stopy Zmiana

perl algorithm bioinformatics dna-sequence 2009-03-02

---