scipy

19Ciepło

3Odpowiedz

Najszybszy splot 2D lub filtr obrazu w języku Python

Kilku użytkowników pytało o szybkość lub zużycie pamięci w nawijaczach obrazów w trybie numpy lub scipy [1, 2, 3, 4]. Z odpowiedzi i mojego doświadczenia z Numpy, wierzę, że może to być poważnym braki

9Ciepło

3Odpowiedz

Załaduj rzadką tablicę z pliku npy

Próbuję wczytać rzadką tablicę, którą wcześniej zapisałem. Zapisanie rzadkiej tablicy było dość łatwe. Próba przeczytania tego jest jednak uciążliwa. scipy.load zwraca tablicę 0d wokół mojej sparse ar

11Ciepło

2Odpowiedz

Interpolacja 3D macierzy NumPy bez SciPy

Piszę wtyczkę dla aplikacji, która zawiera NumPy w dystrybucji binarnej, ale nie SciPy. Moja wtyczka musi interpolować dane z jednej regularnej siatki 3D do innej regularnej siatki 3D. Uruchamiając go

14Ciepło

2Odpowiedz

Elementarna moc scipy.sparse matrix

Jak podnieść macierz scipy.sparse do mocy, elementowo? numpy.power powinny, według its manual to zrobić, ale to nie na macierzach rzadkich: >>> X <1353x32100 sparse matrix of type '<type 'numpy.float

16Ciepło

1Odpowiedz

Skew normalna dystrybucja w scipy

Czy ktoś wie, jak wykreślić skośny rozkład normalny z scipy? Założę się, że klasa stats.norm może być używana, ale nie mogę pojąć, jak to zrobić. Ponadto, w jaki sposób mogę oszacować parametry opisuj

24Ciepło

5Odpowiedz

Python (NumPy, SciPy), znajdowanie pustej przestrzeni macierzy

Próbuję znaleźć pustą przestrzeń (przestrzeń rozwiązania Ax = 0) danej macierzy. Znalazłem dwa przykłady, ale nie mogę sprawić, żeby działały. Ponadto nie mogę zrozumieć, co robią, aby się tam dostać,

5Ciepło

3Odpowiedz

SciPy globalna minimalna krzywa pasuje

Używam scipy.optimize.curve_fit, ale podejrzewam, że zbliża się do lokalnego minimum, a nie do globalnego minimum. Próbowałem za pomocą symulowanego wyżarzania w następujący sposób: def fit(params):

11Ciepło

2Odpowiedz

Matplotlib, więc na osi logowania są tylko nieznaczne znaczniki znaczników w określonych punktach. Zmieniaj także rozmiar etykiet zaznaczania w kolorowym pasku

Próbuję utworzyć wykres, ale chcę, aby ticklabele wyświetlały się tak, jak pokazano, gdzie skala logarytmiczna jest pokazana powyżej. Chcę tylko pomniejszyć ticklabel dla 50, 500 i 2000, aby pokazać.

17Ciepło

1Odpowiedz

Dopasowywanie dystrybucji, dobro dopasowania, wartość p. Czy można to zrobić za pomocą Scipy (Python)?

WPROWADZENIE: Jestem bioinformatykiem. W mojej analizie, którą wykonuję na wszystkich ludzkich genach (około 20 000), szukam konkretnego motywu krótkiej sekwencji, aby sprawdzić ile razy ten motyw wys

16Ciepło

1Odpowiedz

Wywołanie funkcji statystycznych z Scipy

To może być całkiem banalne. chcę wywołać funkcję spearmanr z scipy: (dane są tylko przykłady) import scipy from numpy import * Len = [2,3,5,7,2] Pop = [5,2,6,3,2] a = array(Len) b = array(Pop)